La principal missió de la Taula de Custòdia Marina és debatre i concretar propostes d’ordenació dels usos i activitats corresponents a l’àmbit del Pla de Gestió. S’articula a partir de grups de treball oberts a particular i entitats interessades que desenvolupin la seva tasca en l’àmbit d’aplicació del pla de gestió com els sectors pesquer, científic, administracions, pimes, associacions d’empresaris i ONGs d’utilitat pública vinculades al medi ambient o a la conservació del patrimoni històric o natural.

D’aquesta manera, es vol afavorir la participació dels agents implicats en l’execució de les mesures de gestió del Pla de Gestió Xarxa Natura 2000 de Formentera que engloba un total de 8.518,49 hectàrees repartides en cinc espais. D’aquests, n’hi ha dos (La Mola i Cap de Barbaria) que son marítim-terrestres mentre que els altres tres (Cala Saona, Platja de Migjorn i Platja de Tramuntana) son exclusivament marins.

En aquesta primera sessió, es van constituir tres grups de treball: pesca, coordinació entre administracions i capacitació i divulgació. S’ha acordat reunir novament la taula abans de començar la temporada estival per analitzar el treball fet durant aquest període per cadascun dels grups.