La SD Formentera competirà la temporada 2023-24 al grup tercer de Segona RFEF, grup que estarà format per 18 conjunts de les Illes Balears, Catalunya i el País Valencià.
Al mateix grup hi jugaran els conjunts eivissencs de la Penya Deportiva Santa Eulària i la Penya Independent de Sant Joan, que debuta a la categoria. El quart conjunt balear d’aquest grup serà el CE Andratx, de Mallorca.
La resta del grup 3 està integrat per Atlético Saguntino, Europa, Manresa, Cerdanyola, Badalona Futur, La Nucía, Hércules, Espanyol B, Terrassa, Torrent, Alzira, Lleida Esportiu, Sant Andreu i València Mestalla.
Tenint en compte la classificació de la darrera lliga, tant el filial del València com la Penya Deportiva i l’Espanyol B serien els conjunts més destacats a l’hora de la lluita per a les places d’ascens directe i play-off, tot i que cal tenir en compte també al CE Manresa, quart a la taula en la lliga 2022-23.
